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木霉菌的作用主要体现在五个方面。一是拮抗作用，可通过小分子的抗生素和大分子的抗菌蛋白来抑制住病原菌生长，浸染和繁殖。二是竞争作用，可快速生长繁殖来夺取养分水分，消耗氧气，可消灭灰霉病病原物。三是诱导抗性，可诱导作物使其产生自我防御的系统，从而获得抗病性。还有促生和重寄生作用。
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