一、承包人代付工程款后如何救济?
向发包人追偿;产生争议的，可以向法院起诉主张。
违法分包、非法转包挂靠等造成合同无效时，工程价款的处理办法：
1、如果建筑工程质量合格，可以参照合同约定的结算工程价款进行结算。
2、如果建筑工程经竣工验收不合格，分两种情况处理：
(1)可以修复的，修复后经竣工验收合格，应由承包方承担修复费用;
(2)修复后不合格的，将不支付承包人的工程价款。
如果发包人对建筑工程有过错，也应承担相应责任，如：提供设计不合理，提供或指定购买的材料不符合强制标准，直接指定分包人分包专业工程等。
二、怎样避免工程代付出现纠纷?
1、对于建筑企业：
(1)尽量避免违法分包、非法转包挂靠给没有资质的施工人;
(2)施工中注意对施工设计方案、图纸等材料的搜集、保存;
(3)注意对对方提供的材料进行检验、材料保存;
(4)注意及时进行发函签证;
(5)验收不合格及时修复、修复后及时提交验收材料;
(6)如果发包人以合同无效为由拒绝支付工程款，应以该相关法律为据，据理力争。
2、对发包人：
(1)事前告知或在合同中约定不得违法承包、转包、挂靠;
(2)与设计单位订立好合同、评估设计方案的合理性;
(3)对由发包人提供的建筑材料进行进货凭证的保存、事先的检验以及与承包人共同检验共同签署合格证明等;
(4)及时验收。对于不合格能修复的，计算延误工期，用以索赔，对于不能修复的，拒绝支付工程款。
承包人非法转包、违法分包或没有资质的实际施工人借用资质签订的合同无效
法院可以收缴当事人已经取得的非法所得。这里的非法所得包括：挂靠费、转包费、分包费、手续费、管理费、施工人的毛利等。
因此如果是承包人帮发包人代付了工程款，那么承包人可以向发包人追偿这个工程款，这是承包人的合法权利，但如果发包人用各种借口推辞并且双方产生的争议，那么承包人就可以直接向法院发起起诉，如果的确是存在承包人帮发包人代付工程款的，那么发包人必须要给对方进行补偿。
