1感染
由于蛋白质营养不良，蛋白丢失所致血清IgG及补体因子减少，白细胞功能下降，加之应用糖皮质激素治疗，呼吸道、泌尿系、皮肤及腹腔感染常并发于肾病综合征患者，体腔及皮下积液为感染提供了有利条件。虽然近年强力抗生素的应用，使因感染致死的危险性大大降低，但仍可影响肾病综合征疗效或导致肾病综合征复发。
2血栓栓塞
由于肾病综合征患者大量蛋白的漏出，肝内合成增强，纤维蛋白原及第V、Ⅶ、Ⅷ、X因子增加，抗凝血酶Ⅲ水平降低，蛋白C及蛋白S活性下降，高脂血症致血液粘稠度增加，不合理的利尿，长期使用大量糖皮质激素，患者因此存在高凝状态。卧床增加了肢体发生血栓的可能。目前，血栓、栓塞已成为肾病综合征患者严重的致死性并发症之一。最常见的为肾静脉血栓，另外，肢体静脉血栓、下腔静脉血栓、肺动脉血栓或栓塞也不少见，甚至可见脑血管血栓及冠状血管血栓。
4高脂血症
高脂血症可随蛋白尿消退、血浆白蛋白回升而恢复正常。虽然存在低密度脂蛋白、胆固醇水平增高，但高密度脂蛋白有时亦可升高，有的学者认为能增加心血管并发症的发生率，但也有学者认为危险因素与保护因素同时存在，其对机体的影响尚难确定。但高脂血症可增加血液粘稠度，导致血栓、栓塞的发生，促进肾小球系膜细胞增生及肾小球硬化，因此，积极的饮食控制及药物防治仍有重要意义。
4营养不良
由于长期的低蛋白血症，可引起营养不良，肌肉萎缩，儿童发育迟缓，维生素D缺乏，继发性钙磷代谢紊乱，继发性甲状旁腺功能亢进；药物结合蛋白的减少可加重药物毒性，促使药物代谢增快，减低药物疗效。
5肾功能损伤
低蛋白血症、低血浆胶体渗透压而致水分外渗，部分患者可因血容量下降、肾脏有效循环血容量减少而出现肾前性氮质血症，经积极扩容补液治疗后可缓解。但本病可在无低血容量、无任何诱因的情况下突然发生少尿，肾功能急剧恶化。胶体液扩容不仅无利尿作用，还可导致肺水肿。这类患者年龄多在50岁以上，病理类型多为微小病变，常伴小动脉透明膜样病变及弹力层扩张，肾间质弥漫性水肿，肾小管上皮细胞变性、坏死、脱落，管腔中存在大量蛋白管型。经透析治疗后，多在7周左右自然缓解，其发病机理尚不清楚，可能原因是在肾小球疾病所致滤过率下降、肾小动脉硬化的基础上，对缺血的敏感性增加，肾间质水肿压迫肾小管，大量管型堵塞肾小管管腔而导致肾小球滤过率剧烈减少，肾小管上皮损伤，又从而导致急性肾功能衰竭。
临床上也可见到由于肾小管大量重吸收尿蛋白引起肾小管功能的损伤，可见到肾性糖尿和(或)氨基酸尿，严重者呈部分的范可尼综合征表现。
