原料不同
黑茶因地理气候环境和茶树品种不同，使茶叶原料的品质存在区别;湖南安化黑茶以本地中小叶种茶树为原料，黑茶是很多紧压茶的原料，黑茶压制成的紧压茶有茯砖茶、黑砖茶、花砖茶、湘尖茶、青砖茶、康砖茶、金尖茶、方包茶、六堡茶、圆茶、紧茶……等等。以湖南、湖北、四川、云南、广西等省区为主要产区。
普洱茶是用优良品种云南大叶种，采摘其鲜叶，经杀青后揉捻晒干的晒青茶(滇青)为原料，经过泼水堆积发酵(沤堆)的特殊工艺加工制成。
工艺不同
普洱茶是属于半发酵和后发酵茶叶。黑茶则是全发酵茶叶。
如普洱生茶是把采来的鲜叶萎凋、晒干、蒸压成型后干燥而成，后经吸取空气中的水分和氧气自然陈化。熟普增加了渥堆即人工发酵的过程，减轻了苦涩味。
黑毛茶就是把采摘下来的鲜叶经过杀青、初揉、渥堆、复揉、干燥而成，黑毛茶经蒸压等非常繁复的工序后装篓制成天尖贡尖生尖，蒸压成砖形的是黑砖、花砖，茯砖有一道专门的发花工序，使茯砖内部产生对人体肠胃大有益处的“冠突散囊菌”。不同的地理环境，不同的气侯条件，不同的工艺过程，造成了当今这两大黑茶间的差别。
营养功效不同
黑茶加工的原料是中小叶种，其内含物质相对较低，尤其是有效化学成分含量少，即咖啡碱、茶多酚、茶多糖等有益成分少，微生物作用时间相对短，有益成分的转化也相对少，且黑茶原料化学成分未受光的作用，因此没有光化学的参与。
黑茶是通过高温湿热生物菌渥堆发酵，益生菌逐渐繁殖壮大。因此，茶叶里的茶多酚类物质发生化学变化，干茶乌黑油润，滋味醇厚。茶性是温性，可以暖人的阳气。如果是阳虚体质特征，表现为阳气不足，畏冷，手脚发凉，可多喝黑茶。
普洱茶品质的形成除茶树品种外，直接受光化学和有益微生物的作用，这也是普洱茶品质形成与黑茶不同的关键点。
长期饮用普洱茶能使胆固醇及甘油脂减少，有治疗肥胖症的功用。饮用普洱茶能引起人的血管舒张、血压下降、心率减慢和脑部血流量减少等生理效应，对高血压和脑动脉硬化患者有良好的治疗作用。
